广东省水产学校在后勤管理方面，学校坚持“教务育人、管理育人”的指导思想，食堂、绿化、保安、总务、总务工作等先后实行社会化管理，取得交好的效果。学校两个食堂先后实行承包责任制，并建立相应的监督机制，被省劳动厅授予全省技校“先进食堂”的荣誉称号。学校以就业为导向，根据市场需求不断调整专业设置，开设了水产养殖、航海技术、食品质量安全与控制、环保与水处理、制冷与空调、机电设备安装与维护、电子技术、电子商务、商务外语、经济贸易与管理、物业管理、信息技术与管理等16个专业，水产养殖、制冷与空调两个专业被省教育厅确定为省级骨干示范专业。同时，学校开辟了阳江海水实训中心、广州市番禺淡水养殖实习基地、大亚湾海水种苗实习基地等100多个实习实训基地。