PCR实验室原则上为试剂准备区，样品制备区，扩增区和扩增产物分析区四个单独的工作区域，并设有专用走廊，各工作区域应设缓冲间，工作区与缓冲间宜安装连锁装置。不同功能的工作区应是分隔独立的，各工作区有明显的标志，不能直通，如果紧密连接，需安装物品传递窗。   

     各区功能及主要设备：（1）试剂准备区：扩增试剂的配置、分装和保存。未设缓冲间的试剂储存和准备区，工作区域为正压。用于扩增的试剂应冰冻储存。主要设备有天平、冰箱、离心机、加样器、振荡器、紫外灯。

（2）样品制备区:实验室样品的混样和测试样品的制备。未设缓冲间时工作区域为负压或减压，可安装排风系统。所有的器具在使用前应经过彻底清洗并消毒，防止交叉污染。主要设备有冰箱、生物安全柜（或洁净工作台、排风柜）、离心机、加样器、振荡器、恒温水浴、上下水装置、废弃物容器、紫外灯。根据制备样品的性质和要求决定操作台是选用生物安全柜、洁净工作台还是排毒柜，如疾病控制中心、临床医学实验室一般选用生物安全柜，植物转基因、检疫等可选用排毒柜样品制备需要较高洁净条件的选用洁净工作台。

（3）扩增区：PCR扩增反应体系的配置和模板的加入，核酸扩增。未设缓冲间的扩增区，工作间区域为负压或减压，可安装排风系统。加样应在超净工作台（生物安全柜）内进行，超净工作台的气流方向一选择垂流式。核酸扩增设备、冰箱、洁净工作台、离心机、加样器、废弃物容器、紫外灯。